FPGA基因测序加速服务介绍
FPGA基因测序加速为企业提供海量基因组数据分析所需要的计算加速服务，大幅度提升计算性能，同时保证测序精准度，助力精准医疗、药物研发、分子育种等领域解决性能瓶颈。
功能描述
测序数据与参考基因组比对
支持BWA比对软件的FPGA异构加速，显著提升BWA计算效率，大大缩短数据比对时间。经测试30x人重测序数据(90GB)比对耗时从常规的20小时下降到2.5小时以内，且比对准确度完全一致。
单个样本Germline遗传变异检测
支持GATK v3.8和GATK v4.0.6版本的HaplotypeCaller模式FPGA异构加速，提高germline突变检测运行效率，一致率高达99.5%；经测试30x人重测序数据(90GB)采用BWA+GATK(HaplotypeCaller)的FPGA加速计算germline突变检测，耗时可达6小时以内。
肿瘤样本Case-control样本变异检测
支持GATK v3.8和GATK v4.0.6版本的Mutect2模式FPGA异构加速，提高Somatic突变检测运行效率，一致率高达99.5%。
群体基因型GVCF检测
支持GATK v3.8和GATK v4.0.6版本的HaplotypeCaller--emitRefConfidence GVCF+GenotypeGVCFs模式FPGA异构加速，提高群体样本基因型GVCF检测效率，一致率高达99.5%。
