如何配置StringTie
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简介
StringTie是一种快速高效的RNA-Seq序列比对组装器。它的输入不仅包括其他转录本汇编程序也可以使用短读序列的对比。为了在实验之间鉴定差异表达的基因，可以使用Ballgown，Cuffdiff或其他（DESeq，edgeR等）专用软件来处理StringTie的输出。
配置流程
1.配置编译环境
安装相关依赖
yum install-y zlib zlib-devel
2.获取源码
获取“stringtie-1.3.6”源码包。
cd/usr/local/
wget https://github.com/gpertea/stringtie/archive/v1.3.6.tar.gz
3.编译和安装
1）解压并进入源码包。
cd/usr/local/
tar-zxvf v1.3.6.tar.gz&&cd stringtie-1.3.6
2）编译stringtie。
make-j4 release
4.运行和验证
查看stringtie版本信息。
./stringtie--version
当系统回显类似如下信息时，表示stringtie安装成功。
