SeqTK是什么
简介
SeqTK是一种快速轻巧的工具，用于处理FASTA或FASTQ格式的序列。它可以无缝解析FASTQ和FASTA文件，也可以选择使用gzip对其进行压缩。
配置流程
1.配置编译环境
安装相关依赖。
yum install-y zlib-devel
2.获取源码
获取“Seqtk-1.3”源码包。
cd/usr/local/ wget https://github.com/lh3/seqtk/archive/v1.3.tar.gz
3.编译和安装
1）解压并进入源码包。
tar-zxvf v1.3.tar.gz&&cd seqtk-1.3
2）编译SeqTk。
make-j4
3）创建软链接。
ln-s/usr/local/seqtk-1.3/seqtk/usr/bin/seqtk
4.运行和验证
查看SeqTK使用方法。
seqtk
回显如下信息表示SeqTK安装成功。
Usage:seqtk<command>><arguments> Version:1.3-r106 Command:seq commom transformation of FASTA/Q comp get the nucleotide composition of FASTA/Q sample subsample sequence ... ...
