MISO是什么意思
简介
MISO（同工型混合物）是一种概率框架，可从RNA-Seq数据中定量分析可变剪接基因的表达水平，并鉴定样品中差异调控的同工型或外显子。通过从RNA-Seq中的同工型产生读数的生成过程进行建模，MISO模型使用贝叶斯推断来计算读数源自同工型的可能性。
配置流程
1.配置编译环境
安装相关依赖。
yum install gcc gcc-c++gcc-gfortran python36 python36-devel python36-numpy python36-numpy-f2py libjpeg-turbo-devel freetype-devel bzip2 bzip2-devel libpng libpng-devel openblas openblas-devel xz xz-devel-y
2.编译和安装
安装misopy。
pip3 install misopy
3.运行和验证
1）查看python模块安装列表。
pip3 list cycler(0.10.0) kiwisolver(1.2.0) matplotlib(3.2.1) misopy(0.5.4)
2）Python中引入misopy模块使用。
python3 import misopy as mis print(mis.__version__)
打印出如下信息，说明misopy可以正常使用。
0.5.4
