HTSlib是什么
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简介
HTSlib是一个C库，用于读取和写入高通量测序数据。HTSlib是SAMtools使用的核心库。HTSlib还提供了bgzip，htsfile和tabix实用程序。
配置流程
1.配置编译环境
安装相关依赖。
yum install zlib-devel bzip2 bzip2-devel xz-devel-y
2.获取源码
获取“htslib-1.10.2”源码包。
cd/usr/local/src wget https://github.com/samtools/htslib/releases/download/1.10.2/htslib-1.10.2.tar.bz2
3.编译和安装
1）解压并进入源码目录。
tar-jxvf htslib-1.10.2.tar.bz2 cd htslib-1.10.2
2）配置生成Makefile。
./configure
3）编译安装。
make-j4 make install
4.运行和验证
查看HTSlib引用程序版本信息。
bgzip--version htsfile--version tabix--version
当系统回显类似如下信息是，表示HTSlib安装成功。
[root ecs~]#bgzip--version bgzip(htslib)1.10.2 Copyright(c)2019 Genome Research Ltd. [root ecs~]#htsfile--version htsfile(htslib)1.10.2 Copyright(c)2019 Genome Research Ltd. [root ecs~]#tabix--version tabix(htslib)1.10.2 Copyright(c)2019 Genome Research Ltd.
