HTSeq是什么
简介
HTSeq是使用Python编写的一支用于进行基因Count表达量分析的软件，能根据SAM/BAM比对结果文件和基因结构注释GTF文件得到基因水平的Counts表达量。HTSeq进行Counts计算的原理简单易懂，容易上手。
配置流程
1.配置编译环境
安装相关依赖。
yum install python36 python36-devel openblas python36-numpy python36-Cython bzip2-devel xz-devel zlib-devel-y
2.编译和安装
安装HTSeq。
pip3 install HTSeq
3.运行和验证
1）查看Python模块安装列表。
pip3 list
...
HTSeq(0.12.4)
...
2）Python中引入HTSeq模块。
python3
import HTSeq as ht
print(ht.__version__)
出现类似如下回显表示HTSeq可以成功使用。
0.12.4
