时间：2020-11-04 17:13:59 简介 HTSeq是使用Python编写的一支用于进行基因Count表达量分析的软件，能根据SAM/BAM比对结果文件和基因结构注释GTF文件得到基因水平的Counts表达量。HTSeq进行Counts计算的原理简单易懂，容易上手。 配置流程

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时间：2020-11-04 16:24:00 简介 bedtools实用程序是用于处理基因组信息分析的强大工具集合。例如，bedtools允许人们以广泛使用的基因组文件格式（ 例如BAM，BED，GFF/ GTF，VCF）与多个文件中的基因组间隔相交，合并，计数，互补和混洗。虽然每个工具都设计为执行相对

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云知识 HTSlib是什么 HTSlib是什么 时间：2020-11-03 10:43:01 简介 HTSlib是一个C库，用于读取和写入高通量测序数据。HTSlib是SAMtools使用的核心库。HTSlib还提供了bgzip，htsfile和tabix实用程序。 配置流程 1.配置编译环境

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大数据分析 云计算 基础的公有云大数据服务较难充分满足物联网数据分析的要求原因包含： 1. 缺乏最佳实践，学习成本/开发门槛高； 2. 缺少物联网基因，影响IoT开发效率； 3. 功能分布零散，开发体验差。 文中课程 更多课程、微认证、沙箱实验尽在华为云学院 基

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华为云计算 云知识 edgeR是什么 edgeR是什么 时间：2020-11-03 16:03:07 简介 edgeR是R语言软件包，主要用于DNA测序技术产生的计数数据差异分析。特别是设计用于RNA-Seq或SAGE数据的差异表达分析。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装相关依赖。 apt-get

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什么是Miniasm 什么是Miniasm 时间：2020-11-05 10:01:08 简介 Miniasm是由李恒开发，适合于小基因组及重复序列比例低的基因组组装，相对于Canu和Falcon软件，Miniasm组装速度非常快。建议通过git下载最新版本。 配置流程 1.配置编译环境

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每个独立的处理任务都配有专用的芯片部分，能在不受其它逻辑块的影响下自主运作。 FPGA实例应用场景包含基因计算、金融分析、深度学习、大数据、加解密等，例如FPGA针对特定算法，如快速傅里叶变换，基因序列比对算法(Smith-Waterman)，实现快速计算，纳秒级延时，提升计算性能。 FPGA加速云服务器技术规格特点如下：

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时间：2020-11-04 16:48:09 简介 GATK全称Genome Anlysis Toolkit，是一套用于分析基因组的工具箱。主要功能是寻找变异位点和基因分型，用于从sequencing数据中进行variant calling，包括SNP、INDEL。 配置流程 1.配置编译环境

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华为云计算 云知识 Wtdbg2是什么 Wtdbg2是什么 时间：2020-11-05 11:29:41 简介 Wtdbg2是一个三代测序数据（同时适用于pacbio和nanopore）denovo组装软件，它是一款基于C语言开发的开源软件。相较于其他三代数据组装软件(Canu，

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只能在E CS /BMS中挂载使用，不能被操作系统应用直接访问，需要格式化成文件系统进行访问。 使用场景 如大数据分析、静态网站托管、在线 视频点播 、基因测序和智能视频监控等。 如高性能计算、企业核心集群应用、企业应用系统和开发测试等。 说明： 高性能计算：主要是高速率、高IOPS的需求，用于

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Subread如何安装 时间：2020-11-03 15:37:24 简介 一种通用的read对比软件，它可以对比基因组DNA-seq和RNA-seq的reads，也可以用于发现基因组突变，包括短插入缺失和结构变异。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装相关依赖。 yum install-y

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超高I/O型 弹性云服务器 适用于高性能关系型数据库，NoSQL数据库(Cassandra、MongoDB等)以及ElasticSearch搜索等场景。 （5）高性能计算型 基因工程、游戏动画、生物制药的计算和存储系统。 （6）GPU加速型 GPU加速型云服务器（GPU Accelerated Cloud Server

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Bowtie是一个快速的，较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具。它在拼接35碱基长度的序列时，可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具，它不同于Blast等。它适合的工作是将小序列对比至大基因组上去。它最长能读取1024个碱基的片段。 配置流程 1

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大规模网络容器实例调度：支持大规模、高并发的容器创建和管理 随启随用、按需付费：容器按需启动，按资源规格和使用时长付费 图1大数据AI计算场景 生物基因、药物研发等科学计算 生物基因、药品研发等领域需要高性能、密集型计算，同时对成本较敏感，需要低成本、免运维的计算平台。科学计算一般都是任务型计算，快速申请大量资源，完成后快速释放。

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独权限控制；表元数据只读权限控制 统一的管理机制 使用统一的 IAM 管理用户（无需单独创建 DLI 用户），支持IAM细粒度授权 基因行业 基因数据处理 现在基因行业有很多基于Spark分布式框架的第三方分析库，如ADAM、Hail等 痛点： •安装ADAM、Hail等分析库比较复杂 •每次新建集群都需要安装一遍

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smartdenovo是什么 时间：2020-11-05 11:04:16 简介 smartdenovo是一个同时适用于pacbio和nanopore测序数据的denovo组装软件，它是一款基于C语言开发的开源软件。相较于其他组装软件(如：canu、falcon)，smartdenovo组装可从raw

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SpeedSeq是什么 时间：2020-11-03 14:58:13 简介 SpeedSeq是一个快速基因组分析和注释的灵活框架，发表在Nature Method上，封装了大量基因组分析的软件，比如比对软件BWA，calling SNP软件freebays，SV鉴定软件lumpy等。

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适用于均衡场景，针对出海特定场景，助力企业出海 适用于网站和Web应用、中轻载电商平台搭建、中轻载企业应用 适用于大数据、HPC(渲染、基因)、政企应用、建站、电商等 适用于对计算和网络性能和稳定性要求较高的场景   带宽 5M 5M 5M 5M 5M   数据盘 100G 100G

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为各行各业量身定做的特色OA应用来了-下 相关推荐 应用场景:高校/培训机构 产品概述:Classroom特性 方案概述:方案架构 应用场景:基因组分析 Kubeflow部署:Kubeflow的诞生背景 使用Kubeflow和Volcano实现典型AI训练任务:Kubeflow的诞生背景和运行AI计算任务面临的问题

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术让农业真正走向数字化、智能化。 种业是农业的“芯片”，是关系国计民生的战略性、基础性核心产业。基因育种技术的难点之一在于研究对象极其复杂。“宇宙原子数量约为10的80次方，而在基因育种中，科学家研究对象的复杂度更远远超过这个数字亿万倍。”吴刚介绍，华为推出的AI大模型，集合了技

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产品概述:Classroom特性 Kubeflow部署:Kubeflow的诞生背景 应用场景:基因组分析 使用Kubeflow和Volcano实现典型AI训练任务:Kubeflow的诞生背景和运行AI计算任务面临的问题 应用场景:生物基因、药物研发等科学计算 方案概述:方案架构 导读 软件DevOps云化发展的趋势:华为公司管理过程的变化

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