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功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
数据管理 数据管理简介 添加数据 发布数据 数据管理常用操作 归档数据 数据控制与数据审计 命令行工具概述 父主题： 用户指南（基因平台）
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 instance-id 无 是 数据库实例id，其中引用数据库实例时可以引用多个数据库实例，用分号(;)分隔；导入数据到数据库时不支持多个实例id。 --project -p 否 源项目名称，使用此参数时代表引用数据库实例。 --skip-lines
获取项目ID、项目、账号信息 项目ID、项目名称、账号名（domain name）、账号id（domain id）可登录控制台“我的凭证”页面获取。 父主题： 认证信息
数据管理命令 列举对象 显示当前目录 切换路径 文件拷贝 创建子目录 上传数据 清理本地记录的上传文件 下载数据 删除数据 数据导入 创建归档 获取归档数据 删除归档 恢复归档 获取数据归档列表 修改归档区域 获取数据作业 删除数据作业 重试数据作业 取消数据作业 移动对象 增量同步
创建子用户 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面，单击左上角“创建用户”，进入“创建用户”页面。 填写用户信息，分配子用户权限。 创建完成后，单击“确认”。 父主题： 用户管理
获取示例数据 本示例中使用小分子化合物SMILES结构式文件和蛋白3D结构PDB文件作为输入数据，可通过如下方式获取。 登录医疗智能体平台，在“资产市场”中订阅“docking summary测试数据”至所需的项目中。 图1 示例数据 父主题： 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选
节约研发成本。 产品优势 提供开放的、易于扩展的平台架构。 提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产，提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程，并结合华为特有的高性能云计算，多样性算力，大数据等技术加速计算过程。
”、“\t”，除此之外您也可以使用其他分隔符。以图1为例，分隔符为制表符，创建数据库时，分隔符填写为“\t”，有效数据从第2行开始，跳过文件行数填写为1。 在本地编写.csv、.txt、.vcf文件时，文件编码格式使用UTF-8。 为保证查询性能，建议数据库行数小于500万行，若超过该量级，建议拆分数据库。
导入的模板，可以在“导入模板名称”中修改模板名称，单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板，您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用，数据库模板支持yaml或yml格式，且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”，单击“下载示例文件”下
以通过搜索应用名称快速查找所需应用。应用列表展示了应用的名称、版本、创建者、修改时间、创建时间和可执行的操作。 详细的应用创建和使用请参见工具管理。 创建应用 应用是生物信息学软件的镜像封装，您可以制作软件镜像并上传至平台，并通过“新建应用”引入相关软件。 导入应用 应用按项目进
服务器在完成请求时发生冲突。 返回该状态码，表明客户端尝试创建的资源已经存在，或者由于冲突请求的更新操作不能被完成。 410 Gone 客户端请求的资源已经不存在。 返回该状态码，表明请求的资源已被永久删除。 411 Length Required 服务器无法处理客户端发送的不带Content-Length的请求信息。
com/v1/{project_id}/nextflow/engines { "version" : "1.0.0" } 安装Nextflow，上传本地名为test.txt的Nextflow文件 { "total_part" : 1, "part_number" : 1, "file_name"
购买CSS资源 登录CSS云搜索服务。 单击“创建集群”。 图1 创建集群 基础配置：选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”，输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格：参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs
项目开发者可在项目内执行完整的操作，如Notebook、流程管理等，但无项目分享等权限。 上传者 项目数据上传者，可通过EIHealth平台或命令行工具上传数据。无法执行流程和Notebook等操作。 观看者 项目查看人员仅具备项目查看权限，无项目操作权限。 表2 角色权限 成员角色 所有者
创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选可以使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。 使用步骤如下所示。 登录医疗智能体平台，在“资产市场”中订阅“Docking Summary”流程至所需的项目中。 进入“专题”页签，单击“新建研究”。 图1 新建研究
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