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选择配体文件 单击“下一步”，在对接设置页面配置相关参数。 图3 设置参数信息 对接引擎：对接引擎支持DSDP和AutoDock Vina。DSDP是由北大高毅勤团队研发的基于GPU加速的对接方法。 配置受体口袋位置，如果包含多个受体文件，需要每个受体都进行口袋设置，才能单击提交。 原始配体
作业清理配置 获取作业配置 设置作业配置 父主题： 系统管理
最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码： 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 归档设置记录总数 configs Array of GetArchiveConfigRsp objects 配置项 表4 GetArchiveConfigRsp
task-4-qvina-w：分子对接。 task-5-docking summary：汇总分子对接结果。 图4 数据路径和流程图 图5 设置数据库 设置完成后，单击“提交”，执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务，允许取消、强制停止或删除。 图6 运行状态 查看执行结果 药物和
图1 AI模型 单击“创建模型”，设置相关参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 模型名称。 长度为5-32个字符，首位需以英文字母开头，仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型，基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型，分子描述符不一样。
节点标签管理 设置节点标签 获取节点标签集 获取节点标签集 获取预置标签列表 父主题： 系统管理
选择“自定义”镜像。 工作环境 选择“autogenome”镜像。 CPU 设置CPU为8.0核。 GPU 设置GPU为1.0。 内存 设置内存大于50G。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标，设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据，可将数据提前上传至对应的OBS路径下。
则后面就不会对其进行FEP计算。在相似度返回之前，您也可以直接选择配体对进入下一步。 图4 选择计算路径 单击“下一步”，进入FEP设置页面，设置相关参数。 时间步长：默认值：0.002，取值范围：0.001 ≤ dt ≤ 0.005，单位：ps。分子动力学模拟的步长，建议不超过0
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
平台ID与“命令行工具 > 步骤3 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”，获取平台ID。 图3 个人设置 图4 平台ID 父主题： 配置命令行工具
用户指南（盘古辅助制药） 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 相关参数
-o 否 输出路径。不指定时，以当前项目的根目录为工作路径。 --timeout -t 否 超时时间。运行时间超过设置时间时，认为超时，默认1440分钟，最大可设置为144000分钟。 --labels -l 否 标签。多个标签使用;符号分隔开。 --project 无 否 指定
产品功能 eihealth-toolkit提供了以下功能： 系统设置 您可以使用该工具获取系统标签、系统资源、系统配额信息、消息列表，查询和修改消息及完成作业保留配置，也可以获取和修改供应商logo、名称设置。 项目管理 您可以使用该工具获取、切换、创建、更新、删除和转移项目，也可以添加、修改、移除项目成员角色。
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 image_id 是 String 镜像id 最小长度：1 最大长度：128 project_id
task-4-qvina-w：分子对接。 task-5-docking summary：汇总分子对接结果。 图3 数据路径和流程图 图4 设置数据库 设置完成后，单击“提交”，执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务，单击图标，允许取消、强制停止或删除。 对于“已取消”、“运行失败
图4 拖拽应用 设置输入、输出关系。 fastp的两个输出参数fq-file1和fq-file2是bwa-mem算法的输入参数，bwa-mem的sorted-bam参数是bamqc与picard-insertsize输入参数，参考图进行连接。 图5 设置输入、输出关系 若想修
单击“新建应用”，创建fastqc应用。 图3 设置镜像名称、版本等信息 镜像启动命令如下所示。镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号{}扩起，以$符号进行引用。 fastqc -f fastq -o ${output-dir} ${input-file} 图4 设置CPU、内存、输入输出参数
选择IAM用户登录，填写账号名、IAM用户名、密码，登录平台。 账号名：与管理员（购买平台的账户）的账号名一致。 IAM用户名、密码：创建子用户时设置的用户名和密码。 图2 IAM用户登录界面 父主题： 用户管理
单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。 下载流程参数 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程参数后的“下载”，可下载该流程设置的参数文件。 图1 下载流程文件/参数 父主题： Nextflow
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