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在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在集群上运行MPI应用。 IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景) 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
修订记录 发布日期 修订记录 2022-08-10 第十次正式发布 新增基于STAR-CCM+部署HPC集群 2021-08-11 第九次正式发布。 新增 1.1-图解HPC解决方案 2019-02-15 第八次正式发布。 新增 配额调整 2018-09-30 第七次正式发布。 修改
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
常见问题 为什么集群被删除后还在计费? 在部署/创建集群过程中出现某个节点未加入集群或者不存在需要怎么办? 集群云服务器节点创建完成,但在部署过程中失败了能否修复? 集群创建任务提交失败,提示“Insufficient EIP quota”怎么办? 集群创建提交失败,提示集群配额不足怎么办?
HPC和公有云 公有云上部署HPC的优势 传统的HPC使用中存在如下问题: 投资成本高,扩容部署复杂,重复利用已有投资十分困难。 应用复杂,资源预测困难,灵活性差,亟待提升效率。 效率低下导致决策缓慢,失去市场、以及开发研究成果的良机。 应用计算量快速膨胀,对性能要求越来越高。
277a9fdaf9 图4 创建EIP响应样例 查看规格列表。 Client方式 执行以下命令,查看规格列表。 nova flavor-list 图5 查看规格列表 nova flavor-list | grep h2 图6 查看H2型规格列表 Curl命令方式 URI GET
intel/impi/2018.0.128/lib64 执行下列命令,导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel
2.168.1.0/24,子网网关为192.168.1.1,并为子网开启DHCP功能。 如果默认VPC不能满足您对网络的需求,您可以单击“查看虚拟私有云”创建新的虚拟私有云。 安全组 安全组用来实现安全组内和安全组间裸金属服务器的访问控制,加强裸金属服务器的安全保护。用户可以在安
购买数量:待创建集群中弹性云服务器的数量。 单击“立即购买”。 在确认规格页面,您可以查看详情并提交申请。 如果确认信息无误,单击“提交订单”。 使用私有镜像创建的弹性云服务器创建成功后,您可以在弹性云服务器列表页查看详情,这些云服务器将被用作HPC集群。 API方式 以创建H2型ECS集群为例:
in fi 步骤4 提交作业,且运行期间无中断 在不中断作业的情况下,提交作业并运行,查看作业运行时间。 执行以下命令,提交作业。 qsub job.pbs 作业运行结束后,执行以下命令,查看作业信息。 qstat -f 作业ID 如图3所示,可以看到作业一共运行了4分10秒。 图3
0rc6/lib64 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2 查看MPI环境变量 系统回显结果如图2所示,则环境配置正常。 执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel
弹性云服务器场景支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI
根据界面提示,填写镜像的基本信息。 源:云服务器 弹性云服务器:保持系统默认值 名称:用户自定义镜像名称。 单击“立即申请”。 系统将自动跳转至镜像服务页面,您可以在此页面查看新创建的私有镜像。 API方式 URI POST /v2/cloudimages/action 请求样例 POST /v2/cloudimages/action
ssh $ mv *.pem id_rsa 执行以下命令,给密钥文件配置权限。 $ sudo chmod 600 id_rsa 执行以下命令,查询主机名。 # hostname 执行以下命令,添加本主机私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 示例: 192.168.0
/lib 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2 查看社区OpenMPI环境变量 系统回显结果如图2所示,则环境配置正常。 执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel