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Platform MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用（以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令，安装需要的库文件。
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的，例如LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。
S。 执行以下命令，防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令，添加集群中所有主机的私网IP地址和主机名。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有ECS的私网IP地址和主机名，例如： 192.168.0.1 ecs-ff-0001 192.168.0.2
社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用社区OpenMPI（以3.1.1版本的OpenMPI为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时，需要同时使用Mellanox的HPC-X
Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IBM Spectrum MPI（以IBM Spectrum MPI v10.1为例）。 其中，IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下： IBM Spectrum MPI 10.1.0.1
方案概述 方案应用 HPC提供了超高浮点计算能力解决方案，可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求，如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等，缩短需要的大量计算时间，提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需
RDMA实现 常见的RDMA实现包括虚拟接口架构、基于融合以太网的RDMA(RoCE)、]InfiniBand、iWARP。RDMA的实现方式主要分为InfiniBand和Ethernet两种传输网络。而在以太网上，又可以根据与以太网融合的协议栈的差异分为iWARP和RoCE(包括RoC
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的，不需要安装。 OpenMPI安装（可选） 若使用STAR-CCM+自带的，可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行，推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如：ssh-copy-id
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象： dtest/rping打流测试网络双向不通问题：A机器作为Server端，B机器作为Client端，dtest/rping测试RoCE网络异常；调换A、B机器角色，B机器作为Server端，A机器作为C
b，获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令，添加hosts配置文件。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有ECS的私网IP和主机名，例如： 192.168.0.1 host-192-168-0-1 192.168.0.2 host-192-168-0-2 .
创建HPC私有镜像 前提条件 创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像，需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1，选择启动方式为UEFI图2，否则系统无法启动。
创建SFS Turbo 功能介绍 SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储（NAS），可为云上多个弹性云服务器（Elastic Cloud Server，ECS），容器（CCE&CCI），裸金属服务器（BMS）提供共享访问，能够弹性伸缩至320TB规模，具备高可用性和持久性
STAR-CCM+启动相关问题 STAR-CCM+使用OpenMPI启动时，命令中有"-x"和"--mca"导致启动失败 问题现象： STAR-CCM+使用OpenMPI启动时候命令中同时有"-x"和"--mca"会启动失败，OpenMPI不支持"-x"参数和"--mca"同时使用，报错如下图所示。
在HPC集群上运行Spectrum MPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上，运行Spectrum MPI应用（IBM Spectrum MPI v10.1）。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器，并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
009 sh STAR-CCM+15.02.009_01_linux-x86_64-2.12_gnu7.1-r8.sh # 从STAR-CCM+官网买的正版软件中获取license，将license.dat文件放到/opt/Siemens 中 echo “export CDLMD_LI
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群，流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
2，获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令，添加hosts配置文件。 # vi /etc/hosts 添加的内容为集群中所有ECS的私网IP和主机名，例如： 192.168.0.1 host-192-168-0-1 192.168.0.2 host-192-168-0-2 .
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