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索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库，可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下： 可用：数据库正常，可以进行分子搜索使用。 等待中：数据库创建任务正在等待。 创建失败：数据库创建失败。 创建中：数据库正在创建。
> ${dir-out}/adme.log 2>&1";cat ${dir-out}/adme.log' 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 通过指定“app-id”修改应用。 health
查询配体文件预览任务 功能介绍 查询配体文件预览任务。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview/{task_id} 表1 路径参数 参数
选择AI引擎“Python 3” 编写文件 新建文件后，自动进入文件编写页面，您也可以单击文件名称进入。 图3 编写文件 表1 编写文件页面介绍 区域 区域名称 详细说明 1 文件名称 您可以在此区域填写自定义的文件名称，修改保存后，对应的File列表也将发生变化。 2 菜单栏 菜
流程和运行分析作业时可指定。 新建流程 单击“新建流程”，进入流程设计器页面。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具，详细介绍请参见流程设计器。新建流程时，自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息，填写完成后单击“确定”。 填写流程基本参数，包括“流程
"ei_eihealth_01" --createStartTime "2023-03-07 07:47:54" { "jobs": [ { "id": "a37c22fc-0c8f-4
选择原始配体：选择靶点结构文件中已存在的原始配体用来定位口袋或作为片段优化，存在多个原始配体时可通过下拉框选择，与上传配体文件二选一。 上传配体文件：通过上传与靶点结构有良好结合构象的配体文件确定配体，若文件中包含多个配体，默认只处理第一个，与选择原始配体二选一。仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件，且只支持3D结构。
输出路径。 图6 新建作业 在作业页面添加好运行参数，添加方式与方式1相同。 配置好参数后，单击右上角“启动作业”按钮启动作业，同时会跳转回作业列表。 图7 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 查看方法与方式1相同。 父主题： 运行作业
从而通过身份认证。 AK(Access Key ID)：访问密钥ID。与私有访问密钥关联的唯一标识符；访问密钥ID和私有访问密钥一起使用，对请求进行加密签名。 SK(Secret Access Key)：与访问密钥ID结合使用的密钥，对请求进行加密签名，可标识发送方，并防止请求被修改。
配额管理 盘古辅助制药平台分为基础版和专业版两个版本。 表1 基础版与专业版区别 功能配额 专业版 基础版 用户总数 50 10 项目总数 100 50 单用户创建项目数 20 20 作业并发数 150 30 模型训练&模型管理 支持 不支持 模型训练和模型管理功能预计下个版本上线。
测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合，将不同结构叠合在一起，用于比较结构差异。 输出指定蛋白口袋的位置及大小，用于分子对接。 导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。 父主题： 通用工具
数据，可查询至多设置10个。 描述 当参数设置为可查询时，可以添加描述信息。 是否唯一 对数据表中的一个或多个数据设置唯一约束，保证该数据与表中其他行数据不同，是否唯一至多设置10个。 图1 创建数据库模板 父主题： 数据库管理
选择属性模型：选择AI模型。如果需要创建模型，可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。属性模型的基模型必须与上一步所选择的基模型一致。 输出小分子表征：是否输出小分子表征文件，小分子表征文件可以用作训练模型使用，默认是不输出。 作业名称：设置作业名
oken之后，您就可以使用Token认证调用其他API。 图1 获取用户Token响应消息头 响应消息体 响应消息体通常以结构化格式返回，与响应消息头中Content-type对应，传递除响应消息头之外的内容。 对于获取用户Token接口，返回如下消息体。 { "token":
长度为5-32个字符，首位需以英文字母开头，仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型，基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型，分子描述符不一样。 模型类型 回归型：预测一系列连续变量的模型，主要侧重定量描述。 二分型：预测二分类离散变量的模型，主要侧重定性分析。
stq文件分别指定成fastp-file1和fastp-file2。 图8 设置fastp输入数据 将GRCh38目录指定成bwa-mem与picard-insertsize的输入。 图9 设置bwa-mem输入数据 图10 设置picard-insertsize输入数据 若是想
只支持3D结构，文件大小小于1M。若文件中含有多个配体，默认只处理第一个。 配体力场：支持gaff/gaff2，蛋白力场gromacs力场与配体力场gaff/gaff2不兼容，如果蛋白力场选择了gromacs力场，则不支持上传配体。 图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”，配置靶点优化配置参数。
地。可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改流程yaml模板。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理-
-s命令获取启动分析作业的模板，复制并保存模板至本地，您可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台启动作业过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，启动分析作业。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业
地。可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改应用yaml模板。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用
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