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基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能，通过获取示例数据，创建药物虚拟筛选任务并查看结果。
购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速，使用OBS桶中数据用于本地盘加速，可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶 作业信息填写完成后，单击“确定”，进入流程设计器页面。分别单击输入参数图标，设置输入数据。 表2 参数说明 应用名称
API（医疗智能体平台） 项目管理 系统管理 数据管理 数据库管理 应用管理 资产市场 notebook开发环境 Nextflow接口
是否必选 参数类型 描述 source 是 String 文件来源，支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度：1 最大长度：8 url 否 String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String
Storage Service，简称OBS）是一个基于对象的海量存储服务，为客户提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。 医疗智能体使用OBS存储原始数据、参考组数据、计算结果等。 容器镜像服务（SWR） 容器镜像服务（Software Repository for Cont
平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成，各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 快速入门 关键概念 使用流程 初始化数据盘 什么是ECS
用户指南（盘古辅助制药） 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 相关参数
String 模型数据文件来源。 枚举值： public private url String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 eihealth_project_id String 模型文件所在项目id，仅文件为数据中心时填写。
如果需要设置官能团的约束，可以在约束条件中设置“Substructure”，然后选择“包含”或者“排除”，包含官能团或者去除官能团条件，设置1个官能团数为佳。在官能团设置中，可以单击蓝色按钮来设置生长方向，即我们所优化的分子只会往我们所标记的方向生长。如果在一个Substructure约束条件里面添加多个官能团，
配体列表可显示总条数，但最多展示1000个小分子，对接时使用全量小分子。配体来源包含：数据中心、示例数据、公共库。且公共库预置了分子数据库，包含了陶术数据库、DrugSpaceX数据库、DrugBank数据库可以进行使用，单击“公共库”，可以进行选择。 图2 选择配体文件 单击“下一步”，在对接设置页面配置相关参数。
文件来源，支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度：1 最大长度：8 url String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。
系统管理 计算资源扩缩容 计算资源管理 数据库资源管理 用户管理 作业清理配置 标签管理 消息中心管理 节点标签管理 医疗平台信息获取 性能加速资源管理 资源监控数据获取 存储资源查询 系统配置和供应商配置 系统配额及资源使用情况获取 父主题： API（医疗智能体平台）
Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件，统计测序数据的Insert size的分布。
使用权限。 表1 EIHealth平台用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。详细介绍请参见用户管理。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组，以便用户通过项目进行资源的访
设置内存大小。 取值范围：2~512，默认为2。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标，设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据，可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个，不包含本项目桶最多挂载5个。 用户在Notebook列
可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“设置商标”，设置平台Logo和标语。首次修改时，需同时修改商标和标题。 图1 设置商标 父主题： 系统设置
安全设置 如果创建平台用户时，未填写邮箱或手机号，则在进行安全设置时，会提示设置邮箱或手机号。 如果是最终租户，不支持修改密码。 父主题： 系统设置
算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需计费，计费详情请参考OBS流量费用中“公网流出流量 / 00:00-08:00（闲时）”和“公网流出流量 /
描述 --code -s 是 计算节点规格。 --data-disk-spec-code -d 否 额外数据盘规格。 --extra-data-disk-size -e 否 额外数据盘大小。 单位：G。 默认值：100。 --zone -z 是 可用区id。如：cn-north-7c。
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