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com,电话为12345678910,作业配额为10,作业超时时长为1天,CPU的核数配额为50,内存的配额为128GB,用户可创建的项目数为2 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/users { "name"
应用配置文件说明 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在EIHealth平台,创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建
获取数据库模板 使用get命令获取数据库模板列表、详情或者示例yaml文件。 命令结构 health get database template <template-id> [flags] 或者 health get db template <template-id> [flags]
分子合成规划,列表内是reactions id score Float 当前分子合成路径的得分 请求示例 查询一个分子合成路径规划任务 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/synthesis/{task_id} 响应示例 状态码: 200
描述 id String notebook ID 请求示例 创建notebook,使用系统默认镜像,需要cpu资源1C,内存资源5G。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-pr
、项目可以解除引用OBS类型数据。其他角色的用户仅能使用引用进来的OBS类型数据。 使用URL导入数据 使用URL方式将公网http/https/ftp链接的数据或者OBS中的数据导入。 单击“添加数据”,类型选择“URL”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。
create_time String 作业创建时间 update_time String 作业更新时间 请求示例 查询所有所有药筛study https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/studies 响应示例
数据作业类型 failed_reason String 数据作业失败原因 additions String 附加信息 请求示例 获取数据作业列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-pr
文件为project:/dir/file,属性模型为id为baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep
库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。
导入数据库模板 导入模板 提供两种模板导入方式: 平台支持导入其他项目的模板,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”,预置的模板不支持导入。 在左侧导航栏选择“模板”页签,单击“导入模板”。 导入方式选择“项目”,选择项目名称,勾选需要导入的模板,可以在“
相关参数 物化性质(Physicochemical Property) Molecular Weight (MW): 分子量大小,包含氢原子,最佳分子量在100~600之间。 Molecular Refractivity (MR): 总极化率,取决于分子的温度、折射率和压力。 Volume:
导入结果信息,仅在导入失败时会返回 status String 导入结果状态 请求示例 导入应用,导入后应用名称为dest-demo-app,版本为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-pr
导入模板,从ID为56e0f1b0-ac10-46a5-8fa7-b26831d7d488的项目导入名为import-template的模板 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-pr
查询配体文件预览任务 功能介绍 查询配体文件预览任务。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview/{task_id} 表1 路径参数 参数
上传流程 通过在本地修改流程的yaml模板,上传流程至项目中。 获取流程yaml模板。 单击“上传流程”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get workflow -s命令获取创建流程的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或
-y default-jre perl wget zip # 下载FastQC,解压缩,设置FastQC可执行权限 RUN wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip
-y default-jre perl wget zip # 下载FastQC,解压缩,设置FastQC可执行权限 RUN wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip
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