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因组DNA, 进行高通量测序分析,或克隆DNA到合适的载体,导入宿主菌体,筛选目的转化子等工作。 该流程主要基于Kraken2构建,跟进数据库进行物种注释。 RNA Cufflinks transcriptome analysis process 二代基因组测序即Next Generation
mem_percent Double 内存占用率 rchar Long 读取字符数 wchar Long 写入字符数 read_bytes Long 读取字节数 write_bytes Long 写入字符数 vmem Long process虚拟内存大小 rss Long process实际内存大小
应用场景 靶点发现 在靶点发现阶段,我们提供蛋白质结构预测、靶点口袋发现功能。 苗头化合物发现 在苗头化合物发现阶段,我们提供分子对接、口袋分子设计,分子属性预测功能,在分子对接中,我们预置了大量的分子库可供选择。 先导化合物优化 在先导化合物优化阶段,提供分子优化、靶点口袋分子
String 自动作业创建时间 finish_time String 自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状
也是只能在弱约束里面进行设置。 相似度分数,是利用ECFP4分子指纹计算优化后分子与原始分子的Tanimoto相似性。我们设置了禁止优化列表,禁止以高毒性为优化目标的属性优化,列表为:hERG Blockers,H-HT,DILI,AMES,Skin Sensitization,Carcinogencity,Eye
并发投递多个作业后,部分作业运行失败,日志中显示IO读写相关错误。 图8 运行出错的应用日志 排查思路 检查同一时刻投递作业的输出路径是否存在重复。若存在重复,则很有可能是并发写入同一个文件导致的异常,若不存在请联系服务技术支持解决。 解决方案 平台提供了作业级输出路径,流程级输出路径,子任务级输出路径用于做不同层级
几种不同类型的归档,区别是什么? 标准存储 标准存储访问时延低和吞吐量高,因而适用于有大量热点文件(平均一个月多次)或小文件(小于1MB),且需要频繁访问数据的业务场景。 适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。 归档存储 归档存储适用于很少访问(平均一年访问一次)数据的业务场
新建CPI任务接口 功能介绍 输入蛋白序列、小分子库,创建分子-蛋白互作预测任务。 URI POST /v1/{project_id}/task/cpi 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数
应用场景 基因组分析 提供从基因组数据管理、生物信息分析流程到科研分析管理整个流程的服务,快速实现基因组数据分析及AI建模,提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,基
自由能微扰 自由能微扰基于纯国产分子动力学模拟库SPONGE,产生自动化FEP工作流,端到端计算配体修饰造成的亲和能改变。 单击“自由能微扰”功能卡片,进入上传文件页面。 在上传页面右侧,选择上传受体,上传配体,选择中心配体。 上传受体:受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体:配
查询配体文件预览任务 功能介绍 查询配体文件预览任务。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview/{task_id} 表1 路径参数 参数
制作Docker镜像 制作Docker镜像,有以下两种方法。 快照方式制作镜像(偶尔制作的镜像):在基础镜像上,比如Ubuntu,先登录镜像系统并安装Docker软件,然后整体制作快照,即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像(经常更新的镜像):将软