基因容器 GCS-基于GCS构建基因测序平台:原理说明

时间:2024-05-31 15:31:42

原理说明

G CS 提供了REST API,调用API可以使用GCS提供的所有功能。通过调用GCS的API,您可以构建您自己的测序平台,使得用户无需感知GCS。

图1展示了测序平台(Demo系统)的调用流程,共有如下三种角色。

  • 测序平台的用户:使用测序平台的用户,像医院、科研单位等。
  • 测序平台:面向用户提供测序服务,通过调用GCS的API响应用户的测序需求。当用户想发起测序请求时,调用GCS的API执行测序,待测序完成后获取测序结果并返回给用户。
  • GCS服务:提供底层测序API共测序平台调用。

从上面的描述可以看出,测序平台相当于用户与GCS之间的一个代理,将用户的测序请求转发给GCS处理,然后获取测序结果返回给用户。当然测序平台处理转发测序请求外,还可以做很多其他事情,比如提供用户管理、数据查询等功能,您可以根据自身需求构建。

图1 基于GCS构建测序平台
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