医疗智能体 EIHEALTH-上传数据
时间：2024-11-05 15:55:19
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上传数据
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。
本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到 EIHealth 平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。
- 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。
例如，使用health switch project ngs-project命令进入到名为ngs-project的项目中。
- 使用命令行工具，用mkdir命令创建存储数据的文件夹。
例如，使用health mkdir input-data命令创建名为input-data的文件夹。
- 将本地数据上传至项目文件夹中。
例如，将Linux系统下root/health_test路径中xxx.R1.fastq.gz数据上传至ngs-project项目的input-data文件夹中。
./health upload /root/health_test/xxx.R1.fastq.gz /input-data/
例如，Windows系统下将本地D盘中xxx.R1.fastq.gz数据上传至ngs-project项目的input-data文件夹中。
health upload D:\local\data\xxx.R1.fastq.gz /input-data/
父主题： 基于二代测序的基因组突变检测
support.huaweicloud.com/bestpractice-eihealth/eihealth_32_0004.html
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