医疗智能体 EIHEALTH-查询分子优化作业详情:响应参数

时间:2024-07-13 11:27:04

响应参数

状态码: 200

表3 响应Body参数

参数

参数类型

描述

basic_info

DrugJobDto object

作业基本信息。

smiles

String

分子SMILES表达式。

最小长度:1

最大长度:512

molecule_file

DrugFile object

分子文件。

num_trials

Integer

生成分子数量。

最小值:0

最大值:5000

binding_site

BindSiteDto object

结合位点。

binding_sites

Array of BindSiteDto objects

受体列表和受体是二选一的关系,受体列表优先级最高。

数组长度:0 - 2

weak_constraints

Array of WeakConstraintDto objects

弱约束集合。

strong_constraints

Array of StrongConstraintDto objects

强约束集合。

sampler_mixin_weight

Float

初始化采样权重。

base_model

BaseModel object

基模型。

models

Array of BasicDrugModel objects

模型列表。

cluster_result

ClusterJobRsp object

聚类结果信息。

表4 DrugJobDto

参数

参数类型

描述

id

String

作业id。

name

String

作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。

labels

Array of strings

作业标签。

status

String

作业状态。

type

String

作业类型。

create_time

String

作业创建时间。

finish_time

String

作业结束时间。

start_time

String

作业开始时间。

failed_message

String

失败提示,当作业执行失败时会返回。

user_name

String

创建任务的用户名称。

output_dir

String

作业结果输出目录。

expect_charge_num

Double

预估功能调用消耗次数。

real_charge_num

Double

实际功能调用消耗次数。

progress

Progress object

作业进度信息。

表5 Progress

参数

参数类型

描述

overall

Float

整体进度。

estimated_finish_time

Long

预计结束时间,毫秒。

表6 DrugFile

参数

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如R CS B在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。

枚举值:

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:0

最大长度:10000000

表7 BindSiteDto

参数

参数类型

描述

name

String

靶点名称,只能设置为target1或者target2。

最小长度:1

最大长度:128

receptor

ReceptorDrugFile object

受体文件

bounding_box

BoundingBoxDto object

结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。

remove_ion

Boolean

去除受体中的离子。

缺省值:true

remove_water

Boolean

去除受体中的水分子。

缺省值:true

remove_ligand

Boolean

去除受体中的配体分子。

缺省值:true

add_hydrogen

Boolean

增加氢原子。

缺省值:false

表8 ReceptorDrugFile

参数

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。

枚举值:

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:0

最大长度:10000000

表9 BoundingBoxDto

参数

参数类型

描述

center

Array of floats

口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。

最小值:-9999999

最大值:99999999

数组长度:3 - 3

size

Array of floats

口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。

最小值:2

最大值:500

数组长度:3 - 3

padding

Float

填充。

最小值:0

最大值:20

表10 WeakConstraintDto

参数

参数类型

描述

id

String

自定义模型id,仅弱约束为模型时填写。

最小长度:1

最大长度:128

name

String

属性名称。

最小长度:1

最大长度:128

type

String

属性约束类型。

枚举值:

  • bool
  • range
  • struct
  • minimize
  • maximize
  • interaction

bool

Boolean

属性约束类型bool的参数。

range

Array of floats

属性约束类型range的参数。

最小值:-9999

最大值:9999

数组长度:2 - 2

struct

StructureConstraintParamsDto object

结构约束参数。

quantiles

Array of floats

属性约束类型minimize和maximize的参数。

最小值:0.0

最大值:1.0

数组长度:2 - 2

interaction

InteractionConstraintDto object

相互作用力约束参数。

表11 StrongConstraintDto

参数

参数类型

描述

id

String

自定义模型id,仅强约束为模型时填写。

最小长度:1

最大长度:128

name

String

属性名称。

最小长度:1

最大长度:128

type

String

属性约束类型。

枚举值:

  • bool
  • range
  • struct
  • interaction

bool

Boolean

属性约束类型bool的参数。

range

Array of floats

属性约束类型range的参数。

最小值:-9999

最大值:9999

数组长度:2 - 2

struct

StructureConstraintParamsDto object

结构约束参数。

interaction

InteractionConstraintDto object

相互作用力约束参数。

表12 StructureConstraintParamsDto

参数

参数类型

描述

structs

Array of strings

子结构SMILES。

最小长度:1

最大长度:120

数组长度:1 - 8

exclusive

Boolean

是否排除子结构。

operator

String

多个子结构之间的逻辑关系。

枚举值:

  • or
  • and
表13 InteractionConstraintDto

参数

参数类型

描述

interactions

Array of Interaction objects

相互作用力列表。

数组长度:1 - 8

exclusive

Boolean

是否排除指定的约束作用力。

operator

String

多个作用力之间的逻辑关系。

枚举值:

  • or
  • and
表14 Interaction

参数

参数类型

描述

binding_site

String

靶点,只支持target1或target2。

最小长度:1

最大长度:128

type

String

相互作用力类型:氢键、疏水作用、盐桥、π-π堆积、π-阳离子。

枚举值:

  • hydrogen_bond
  • hydrophobic_action
  • salt_bridge
  • pi_stacking
  • pi_cation

amino_acid

String

氨基酸。

最小长度:4

最大长度:16

表15 BaseModel

参数

参数类型

描述

id

String

基模型id。

缺省值:pangu-drug-model

最小长度:1

最大长度:128

name

String

基模型名称。

缺省值:pangu-drug-model

最小长度:1

最大长度:128

表16 BasicDrugModel

参数

参数类型

描述

id

String

模型ID。

task_id

String

任务ID。

name

String

模型名称。

creator

String

模型创建者。

type

String

模型类型。

value_range

ValueRange object

区间上下限,仅回归型存在。

description

String

模型描述信息。

表17 ValueRange

参数

参数类型

描述

lower

Float

区间下限,仅回归型存在。

upper

Float

区间上限,仅回归型存在。

表18 ClusterJobRsp

参数

参数类型

描述

method

String

分子聚类方法。

output_dir

String

分子聚类输出结果。

status

String

作业结果信息。

failed_reasons

Array of FailedReasonRecord objects

部分失败原因和数量。

表19 FailedReasonRecord

参数

参数类型

描述

reason

String

失败原因。

count

Integer

失败数量。

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