医疗智能体 EIHEALTH-创建靶点口袋发现作业:请求参数

时间:2024-05-10 16:07:33

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

String

用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限, 获取Token 接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

最小长度:1

最大长度:32768

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

basic_info

CreateDrugJobBasicInfo object

作业基本信息。

receptor

ReceptorDrugFile object

受体文件。

ligand

ProbeDrugFile object

探针文件。

params

PocketDetectionParamDto object

靶点口袋发现设置参数。

表4 CreateDrugJobBasicInfo

参数

是否必选

参数类型

描述

name

String

作业的名称,取值范围:[5,64],允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。

最小长度:5

最大长度:64

labels

Array of strings

标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。

最小长度:1

最大长度:32

数组长度:0 - 5

表5 ReceptorDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如R CS B在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。

枚举值:

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:0

最大长度:10000000

表6 ProbeDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。

枚举值:

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,支持PDB、SDF、MOL2,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:0

最大长度:10000000

表7 PocketDetectionParamDto

参数

是否必选

参数类型

描述

timestep_size

Double

时间步长,单位ps。

最小值:0.001

最大值:0.002

缺省值:0.002

num_minimization_steps

Integer

最小化步数。

最小值:5000

最大值:50000

缺省值:20000

pre_equilibrium_time

Integer

预平衡时长,单位ps。

最小值:20

最大值:200

缺省值:100

pocket_detection_time

Integer

口袋发现时长,单位ns。

最小值:20

最大值:50

缺省值:50

num_surface_points

Integer

表面原子离散点数量。

最小值:10

最大值:50

缺省值:20

probe_radius

Double

探针半径,单位A。

最小值:1.4

最大值:5

缺省值:1.4

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