医疗智能体 EIHEALTH-创建靶点优化作业:请求参数
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请求参数
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
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X-Auth-Token |
是 |
String |
用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限， 获取Token 接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 |
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
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basic_info |
是 |
CreateDrugJobBasicInfo object |
创建药物作业基本信息。 |
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receptor |
是 |
TargetOptReceptor object |
受体文件。 |
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ligand |
否 |
TargetOptLigand object |
配体文件。 |
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md_params |
否 |
MdParam object |
MD参数配置。 |
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
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name |
是 |
String |
作业的名称，取值范围：[5,64]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度：5 最大长度：64 |
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labels |
否 |
Array of strings |
标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5 |
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
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file |
是 |
ReceptorDrugFile object |
受体文件。 |
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balanced_charge |
否 |
Boolean |
是否平衡电荷。 缺省值：true |
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water_model |
否 |
String |
水模型, 支持选择spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p。 缺省值：tip3p |
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force_field |
否 |
String |
蛋白立场，支持选择amber03, amber94, amber96, amber99, amber99sb, amber99sb-ildn, amberGS, charmm27, oplsaa, gromos43a1, gromos43a2, gromos45a3, gromos53a5, gromos53a6, gromos54a7。 缺省值：amber99sb |
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ion_type |
否 |
String |
离子种类，支持选择NaCl、MgCl2、None，若设置了平衡电荷不支持选择None。 缺省值：NaCl |
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ion_concentration |
否 |
Float |
离子浓度，单位mol/L，若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。 最小值：0 最大值：5.0 缺省值：0.15 |
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
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source |
是 |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如R CS B在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
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url |
否 |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
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format |
否 |
String |
文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
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data |
否 |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
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file |
是 |
ProbeDrugFile object |
配体文件。 |
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force_field |
否 |
String |
配体力场, 支持选择gaff, gaff2。 缺省值：gaff |
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
source |
是 |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
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url |
否 |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
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format |
否 |
String |
文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
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data |
否 |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
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timestep_size |
否 |
Float |
MD模拟的时间步长，单位fs，取值范围：大于0，小于等于5。 最小值：0 最大值：5.0 缺省值：2 |
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temperature |
否 |
Float |
MD模拟的温度，单位K。 最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：300 |
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step_params |
否 |
MdStepParam object |
计算步骤参数。 |
