医疗智能体 EIHEALTH-批量执行NGS分析:获取NGS作业配置文件
时间：2024-11-05 15:55:19
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获取NGS作业配置文件
编写NGS作业配置文件有两种方式，建议您使用第一种，通过获取已经执行成功的NGS配置文件，并在该配置文件基础上进行修改，得到可以用于批量执行NGS的配置文件。本示例介绍使用方法一获取配置文件的方法。
- 方式一
使用 EIHealth 平台完成NGS流程的搭建，并执行成功，然后在“分析作业”页面导出作业信息.yaml文件。
- 方式二
使用命令行工具完成NGS流程的搭建，进而获取相应的配置文件。详细的操作请参见命令行工具。
- 使用switch命令进入NGS流程所在的项目。
例如，使用health switch project ngs-project命令进入到名为ngs-project的项目中。
- 使用health get job命令获取该项目下所有的作业信息。
- 查询NGS作业对应的job-id，使用health get job job-id命令获取NGS作业的信息。使用health get workflow命令查询NGS作业对应的workflow-id。获取到的作业信息如图1所示。
- health get job -s命令获取启动分析作业的模板。依据模板要求，将步骤3中获取到的NGS作业信息和workflow-id填充至模板中，修改好的配置文件示例请参见NGS配置文件示例。
请将该模板保存为.yaml格式至本地，并在本地完成模板修改。例如，命名为ngs.yaml。
support.huaweicloud.com/bestpractice-eihealth/eihealth_32_0009.html
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