医疗智能体 EIHEALTH-制作并上传镜像:制作gatk-haplotypecaller镜像

时间:2024-11-05 15:55:19

制作gatk-haplotypecaller镜像

  1. 在本地搭建Docker环境。

    要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。

  2. 编写Dockerfile制作gatk-haplotypecaller镜像。

    1. 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
      FROM broadinstitute/gatk:4.1.9.0
      RUN apt-get update
      RUN apt-get install -y parallel
    2. 按Esc键,并执行:wq退出Dockerfile。
    3. 制作镜像。
      docker build -t gatk-haplotypecaller:4.1.9.0 .

      详细的Dockerfile指令请参见Dockerfile参考

support.huaweicloud.com/bestpractice-eihealth/eihealth_32_0005.html