基因容器 GCS-快速开始:安装SDK

时间：2025-02-12 14:52:06

基因容器 GCS

安装SDK

获取G CS SDK安装包 cloud-sdk-python3-gcs-x.x.x.zip。

登录GCS控制台，下载基因容器Python SDK开发包，如下图所示。
图1 Python SDK开发包下载地址

解压SDK安装包。

目录结构如下：

|-- cloud-sdk-python-gcs-x.x.x.zip  |-- gcs-sdk-x.x.x.tar.gz            python3 SDK  |-- cromwell-demo.zip      |-- cromwell_demo      |-- cromwell_demo.py            Cromwell引擎接口使用示例      |-- example.inputs              输入文件      |-- example.options             options文件      |-- example.wdl                 WDL描述文件  |-- gcs-demo.zip      |-- gcs_demo      |-- gcs-grammr.yaml             GCS流程语法文件      |-- gcs_demo.py                 GCS接口使用示例    |-- README.md

下载安装包管理工具pip，并更新到最新版本。
安装SDK。

pip3 install gcs-sdk-x.x.x.tar.gz

如果由于pip版本过低安装失败，请使用如下命令更新pip到最新版本之后再重新安装。

python3 -m pip install --upgrade pip
在Ubuntu中，升级了pip，如果版本跨度较大,再次使用pip 安装相关的python包的时候可能会出现以下错误
```
ImportError: cannot import name main
```
解决方法：pip3文件在usr/bin目录下，cd进去，进行以下修改

把下面的三行
123

from pip import mainif __name__ == '__main__': sys.exit(main())
换成下面的三行
123

from pip import __main__if __name__ == '__main__': sys.exit(__main__._main())
安装完成后，您就可以参考示例代码说明使用。