医疗智能体 EIHEALTH-创建自由能微扰作业:请求参数

时间:2024-12-13 16:14:12

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

String

用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限, 获取Token 接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

最小长度:1

最大长度:32768

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

basic_info

CreateDrugJobBasicInfo object

创建药物作业基本信息。

receptor

ReceptorDrugFile object

受体文件。

ligands

Array of LigandPreviewDto objects

配体列表。

数组长度:2 - 101

graph

FepGraphDto object

路径图。

params

FepParamDto object

FEP设置参数。

表4 CreateDrugJobBasicInfo

参数

是否必选

参数类型

描述

name

String

作业的名称,取值范围:[5,64],允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。

最小长度:5

最大长度:64

labels

Array of strings

标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。

最小长度:1

最大长度:32

数组长度:0 - 5

表5 ReceptorDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如R CS B在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。

枚举值:

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:0

最大长度:10000000

表6 LigandPreviewDto

参数

是否必选

参数类型

描述

index

Integer

配体索引(从0起编号)。

最小值:0

最大值:99

file

DrugFile object

配体文件。

name

String

配体名称,若无名称则自动命名,格式为UNK+索引(从1起编号)。

最小长度:1

最大长度:32

smiles

String

分子SMILES表达式。

最小长度:1

最大长度:512

表7 DrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。

枚举值:

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:0

最大长度:10000000

表8 FepGraphDto

参数

是否必选

参数类型

描述

center_id

String

中心配体名称。

最小长度:1

最大长度:32

pairs

Array of SimilarityDto objects

配体对列表。

数组长度:1 - 100

表9 SimilarityDto

参数

是否必选

参数类型

描述

ligand_ids

Array of strings

配体对。

最小长度:1

最大长度:32

数组长度:2 - 2

表10 FepParamDto

参数

是否必选

参数类型

描述

pre_equilibrium_time

Float

预平衡时长,单位ps,范围为0-200,不包含0,默认为100ps。

最小值:0

最大值:200.0

equilibrium_time

Float

平衡时长,单位ns,范围为0-10,不包含0,默认为1ns。

最小值:0

最大值:10.0

num_pre_equilibrium_steps

Integer

预平衡步数,默认为50000。

最小值:1

最大值:200000

num_equilibrium_steps

Integer

平衡步数,默认为500000。

最小值:1

最大值:10000000

timestep_size

Float

时间步长,单位ps,取值范围:大于0,小于等于0.005。

最小值:0.001

最大值:0.005

缺省值:0.002

num_lambda

Integer

lambda个数。

最小值:2

最大值:30

缺省值:20

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