医疗智能体 EIHEALTH-如何将生物信息学软件封装为镜像并上传?:步骤2:制作镜像
时间:2024-12-18 20:15:26
步骤2:制作镜像
方法1:直接下载官方的FastQC镜像。
执行如下命令下载FastQC镜像。
docker pull biocontainers/fastqc:v0.11.5
方法2:通过Dockerfile制作FastQC镜像。
- 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。
FROM ubuntu:16.04 # FastQC依赖java运行,需安装java环境。安装执行下载、解压缩的软件包 RUN apt-get update && apt-get upgrade -y \ && apt-get install -y default-jre perl wget zip # 下载FastQC,解压缩,设置FastQC可执行权限 RUN wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip \ && unzip fastqc_v0.11.5.zip \ && rm fastqc_v0.11.5.zip \ && chmod +x /FastQC/fastqc # 将FastQC添加到环境变量中 ENV PATH "/FastQC:$PATH
- 按Esc键,并执行:wq退出Dockerfile。
- 制作镜像。
docker build -t fastqc:v0.11.5 .
详细的Dockerfile指令请参见Dockerfile参考。
support.huaweicloud.com/eihealth_faq/eihealth_27_0011.html
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