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基因容器 GCS-创建execution:输入参数

输入参数表1 输入参数参数是否必选参数类型参数描述 workflow_source_file 否 String WDL的本地绝对路径。当parameters参数中存在"workflow_id"或"workflow_source"字段指定非本地wdl来源时，该参数可不赋值。 workflow_inputs_file 否 String 输入文件的本地绝对路径。当parameters参数中存在"workflow_inputs"字段指定非本地input来源时，该参数可不赋值。 workflow_options_file 否 String options文件本地绝对路径。当parameters参数中存在"workflow_options"字段指定非本地options来源时，该参数可不赋值。 workflow_dependencies_path 否 String dependency本地绝对路径，必须是zip文件或目录。若为目录，将自动压缩为zip文件置于/home目录下。当parameters参数中存在"workflow_depends"字段指定非本地dependency来源时，该参数可不赋值。 parameters 是 Dictionary 提交需要用到的其他参数，当前支持以下参数： env_name：必选参数，任务提交到的Cromwell环境名称 workflow_id：可选参数，当workflow_source_file已赋值或parameters中存在workflow_source字段时，可不指定该字段 workflow_source：可选参数，当workflow_source_file已赋值或parameters中存在workflow_id字段时，可不指定该字段 workflow_inputs：可选参数，当workflow_inputs_file已赋值时，可不指定该字段 workflow_options：可选参数，当workflow_options_file已赋值时，可不指定该字段 workflow_depends：可选参数，当workflow_dependencies_path已赋值时，可不指定该字段 enterprise_project_id：可选参数，不使用企业项目时无需指定，execution的企业项目id，默认为“0”，表示default的企业项目

基因容器 GCS 执行结果
基因容器 GCS-创建execution:示例

示例 // 使用本地文件提交任务wf_source = "/home/test/test.wdl"wf_inputs = "/home/test/test.inputs"wf_options = "/home/test/test.options"wf_dependencies = "/home/test/dependency/" # dependency目录，将自动生成压缩包提交,也可以赋值为已压缩好的dependency文件路径param = { "env_name": "cromwell_env",}cromwell_client.create_execution(workflow_source_file=wf_source, workflow_inputs_file=wf_inputs, workflow_options_file=wf_options, workflow_dependencies_path=wf_dependencies, parameters=param)// 使用OBS对象提交任务param = { "env_name": "cromwell_env", "workflow_source": "obs://bucketName/path", "workflow_inputs": "https://bucketName.obs.cn-north-4.myhuaweicloud.com:443/path/object", "workflow_options": "https://bucketName.obs.cn-north-1.myhuaweicloud.com:443/path/object", "workflow_depends": "https://bucketName.obs.cn-north-1.myhuaweicloud.com:443/path/object"}cromwell_client.create_execution(parameters=param)// 使用workflow_id方式提交任务param = { "env_name": "cromwell_env", "workflow_id": "xxxxxxxx-xxxx-xxxx-xxxx-xxxxxxxxxxxx", # WDL流程在G CS 中的ID "workflow_inputs": "https://bucketName.obs.cn-north-4.myhuaweicloud.com:443/path/object", "workflow_options": "https://bucketName.obs.cn-north-1.myhuaweicloud.com:443/path/object", "workflow_depends": "https://bucketName.obs.cn-north-1.myhuaweicloud.com:443/path/object"}cromwell_client.create_execution(parameters=param)

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