靶点口袋发现作业管理-华为云

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点口袋发现作业详情:响应示例

响应示例状态码： 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "POCKETDETECTION", "start_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "params" : { "timestep_size" : 0.001, "num_minimization_steps" : 20000, "pre_equilibrium_time" : 100, "pocket_detection_time" : 50, "num_surface_points" : 30, "probe_radius" : 1.4 }, "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "ligand" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" } }

医疗智能体 EIHEALTH 靶点口袋发现作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点口袋发现作业详情:URI

URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection/{job_id} 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 project_id 是 String 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String 作业id。最小长度：1 最大长度：128

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医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点口袋发现作业详情:响应参数

响应参数状态码： 200 表3 响应Body参数参数参数类型描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件。 ligand ProbeDrugFile object 探针文件。 params PocketDetectionParamDto object 靶点口袋发现设置参数。表4 DrugJobDto 参数参数类型描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。表5 Progress 参数参数类型描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间，毫秒。表6 ReceptorDrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如R CS B在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表7 ProbeDrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表8 PocketDetectionParamDto 参数参数类型描述 timestep_size Double 时间步长，单位ps。最小值：0.001 最大值：0.002 缺省值：0.002 num_minimization_steps Integer 最小化步数。最小值：5000 最大值：50000 缺省值：20000 pre_equilibrium_time Integer 预平衡时长，单位ps。最小值：20 最大值：200 缺省值：100 pocket_detection_time Integer 口袋发现时长，单位ns。最小值：20 最大值：50 缺省值：50 num_surface_points Integer 表面原子离散点数量。最小值：10 最大值：50 缺省值：20 probe_radius Double 探针半径，单位A 最小值：1.4 最大值：5 缺省值：1.4

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医疗智能体 EIHEALTH-创建靶点口袋发现作业:请求示例

请求示例创建靶点口袋发现作业，作业名称为demo-job，受体文件为project:/dir/file，时间步长为0.001ps，最小化步数为20000，预平衡时间为100ps，口袋发现时长为50ns，表面原子离散点数量为30，探针半径1.4A。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection { "basic_info" : { "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA" ] }, "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "ligand" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "params" : { "timestep_size" : 0.001, "num_minimization_steps" : 20000, "pre_equilibrium_time" : 100, "pocket_detection_time" : 50, "num_surface_points" : 30, "probe_radius" : 1.4 } }

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医疗智能体 EIHEALTH-创建靶点口袋发现作业:响应示例

响应示例状态码： 201 CREATED 创建靶点口袋发现作业成功。 { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建靶点口袋发现作业成功，当前运行作业数已达配额限制，此作业会等待。 { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "limit_concurrency" : 50 }

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医疗智能体 EIHEALTH-创建靶点口袋发现作业:请求参数

请求参数表2 请求Header参数参数是否必选参数类型描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token 接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数参数是否必选参数类型描述 basic_info 是 CreateDrugJobBasicInfo object 作业基本信息。 receptor 是 ReceptorDrugFile object 受体文件。 ligand 是 ProbeDrugFile object 探针文件。 params 否 PocketDetectionParamDto object 靶点口袋发现设置参数。表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数是否必选参数类型描述 name 是 String 作业的名称，取值范围：[5,64]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。最小长度：5 最大长度：64 labels 否 Array of strings 标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5 表5 ReceptorDrugFile 参数是否必选参数类型描述 source 是 String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data 否 String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表6 ProbeDrugFile 参数是否必选参数类型描述 source 是 String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data 否 String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表7 PocketDetectionParamDto 参数是否必选参数类型描述 timestep_size 否 Double 时间步长，单位ps。最小值：0.001 最大值：0.002 缺省值：0.002 num_minimization_steps 否 Integer 最小化步数。最小值：5000 最大值：50000 缺省值：20000 pre_equilibrium_time 否 Integer 预平衡时长，单位ps。最小值：20 最大值：200 缺省值：100 pocket_detection_time 否 Integer 口袋发现时长，单位ns。最小值：20 最大值：50 缺省值：50 num_surface_points 否 Integer 表面原子离散点数量。最小值：10 最大值：50 缺省值：20 probe_radius 否 Double 探针半径，单位A。最小值：1.4 最大值：5 缺省值：1.4

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医疗智能体 EIHEALTH-创建靶点口袋发现作业:URI

URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 project_id 是 String 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128

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