作业管理-华为云

医疗智能体 EIHEALTH-分析作业管理简介

分析作业管理简介分析作业依托于流程运行，需要您先创建流程，再基于流程创建分析作业。在“项目管理”页面“作业”页签中，以列表形式展示了项目中运行的分析作业和运行状态。您可以查看分析作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业，支持通过作业名称、流程名称、标签、创建者、状态、创建时间和完成时间进行快速搜索。如果需要批量创建分析作业，您可以创建自动作业。当作业执行超时，作业状态显示失败，task状态为运行中。后续task运行成功或失败，作业状态都显示失败。可参考作业投递后处于运行中，运行过程正常，但是最后超时失败进行处理。如果性能加速节点不可用或作业配额不足，重试作业时，超过配额的作业会重试失败。图1 分析作业图2 作业搜索父主题：作业管理

医疗智能体 EIHEALTH 作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询自由能微扰作业详情:响应示例

响应示例状态码： 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "ligands" : [ { "name" : "GLY:A:514", "smiles" : "C1CCCCC1", "index" : 0, "file" : { "source" : "RAW", "format" : "PDB", "data" : "MODEL1.xxxxxxx.END" } }, { "name" : "UNK1", "smiles" : "c1ccccc1", "index" : 0, "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" } } ], "graph" : { "center_id" : "GLY:A:514", "pairs" : [ { "ligand_ids" : [ "GLY:A:514", "DrugBank:UNK1" ] } ] }, "params" : { "num_pre_equilibrium_steps" : 50000, "num_equilibrium_steps" : 500000, "timestep_size" : 0.002, "num_lambda" : 20 }, "job_result" : { "total_count" : 10, "failed_count" : 1 } }

医疗智能体 EIHEALTH 自由能微扰作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询自由能微扰作业详情:响应参数

响应参数状态码： 200 表3 响应Body参数参数参数类型描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件。 ligands Array of LigandPreviewDto objects 配体列表。 graph FepGraphDto object 路径图。 params FepParamDto object FEP设置参数。 job_result JobResult object 作业结果信息。 part_failed_reason Array of FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。表4 DrugJobDto 参数参数类型描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。表5 Progress 参数参数类型描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间，毫秒。表6 ReceptorDrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如R CS B在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表7 LigandPreviewDto 参数参数类型描述 index Integer 配体索引（从0起编号）。最小值：0 最大值：99 file DrugFile object 配体文件 name String 配体名称，若无名称则自动命名，格式为UNK+索引（从1起编号）。最小长度：1 最大长度：32 smiles String 分子SMILES表达式。最小长度：1 最大长度：512 表8 DrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表9 FepGraphDto 参数参数类型描述 center_id String 中心配体名称。最小长度：1 最大长度：32 pairs Array of SimilarityDto objects 配体对列表。数组长度：1 - 100 表10 SimilarityDto 参数参数类型描述 ligand_ids Array of strings 配体对。最小长度：1 最大长度：32 数组长度：2 - 2 表11 FepParamDto 参数参数类型描述 pre_equilibrium_time Float 预平衡时长，单位ps，范围为0-200，不包含0，默认为100ps。最小值：0 最大值：200.0 equilibrium_time Float 平衡时长，单位ns，范围为0-10，不包含0，默认为1ns。最小值：0 最大值：10.0 num_pre_equilibrium_steps Integer 预平衡步数，默认为50000。最小值：1 最大值：200000 num_equilibrium_steps Integer 平衡步数，默认为500000。最小值：1 最大值：10000000 timestep_size Float 时间步长，单位ps，取值范围：大于0，小于等于0.005。最小值：0.001 最大值：0.005 缺省值：0.002 num_lambda Integer lambda个数。最小值：2 最大值：30 缺省值：20 表12 JobResult 参数参数类型描述 total_count Integer 输入总数。 failed_count Integer 失败个数。表13 FailedReasonRecord 参数参数类型描述 reason String 失败原因。 count Integer 失败数量。

医疗智能体 EIHEALTH 自由能微扰作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询自由能微扰作业详情:URI

URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep/{job_id} 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 project_id 是 String 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String 作业id。最小长度：1 最大长度：128

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医疗智能体 EIHEALTH-创建自动作业模板:URI

URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128

医疗智能体 EIHEALTH 自动作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-创建自动作业模板:请求示例

请求示例创建自动作业，自动作业名称为demo-auto-job，使用如下数据库，使用数据库列为user_name。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs { "name" : "demo-auto-job", "description" : "description", "database_id" : "2adc4b5fbeeb4a518f177167074a5fb2", "database_column" : "user_name", "database_column_type" : "NEW", "clean_database_column" : false, "database_trigger" : [ { "name" : "status", "judge_mode" : "gte", "value" : "100" } ], "tool_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "tool_type" : "workflow", "job_name" : "demo-job", "job_name_type" : "AUTO", "job_description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "priority" : 0, "timeout" : 1440, "output_dir" : "/job", "output_dir_type" : "MANUAL", "node_labels" : [ "health.node" ], "io_acc_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "tasks" : [ { "task_name" : "app1-1", "inputs" : [ { "name" : "dir-parameter", "source" : "MANUAL", "values" : [ "/test" ] } ], "resources" : { "cpu" : "1C", "cpu_type" : "X86", "memory" : "1G", "gpu_type" : "GPU", "gpu" : "0" }, "io_acc_type" : "SFS" } ] }

医疗智能体 EIHEALTH 自动作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-创建自动作业模板:响应示例

响应示例状态码： 201 CREATED { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "app_infos" : [ { "app_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "app_name" : "demo-app", "app_version" : "1.0.0", "app_node_labels" : [ "health.node" ] } ], "job_info" : { "job_name" : "demo-job", "job_node_labels" : [ "health.node" ] } }

医疗智能体 EIHEALTH 自动作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点优化作业详情:响应示例

响应示例状态码： 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "receptor" : { "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "balanced_charge" : true, "water_model" : "tip3p", "force_field" : "amber99sb", "ion_type" : "NaCl", "ion_concentration" : 0.15 }, "ligand" : { "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "force_field" : "gaff" }, "md_params" : { "timestep_size" : 2, "temperature" : 300, "step_params" : { "energy_minimization_steps" : 10000, "nvt" : 200, "npt" : 500, "simulation_time" : 50 } } }

医疗智能体 EIHEALTH 靶点优化作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点优化作业详情:响应参数

响应参数状态码： 200 表3 响应Body参数参数参数类型描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptor TargetOptReceptor object 受体文件。 ligand TargetOptLigand object 配体文件。 md_params MdParam object MD参数配置。表4 DrugJobDto 参数参数类型描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。表5 Progress 参数参数类型描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间，毫秒。表6 TargetOptReceptor 参数参数类型描述 file ReceptorDrugFileobject 受体文件。 balanced_charge Boolean 是否平衡电荷。缺省值：true water_model String 水模型, 支持选择spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p。缺省值：tip3p force_field String 蛋白立场，支持选择amber03, amber94, amber96, amber99, amber99sb, amber99sb-ildn, amberGS, charmm27, oplsaa, gromos43a1, gromos43a2, gromos45a3, gromos53a5, gromos53a6, gromos54a7。缺省值：amber99sb ion_type String 离子种类，支持选择NaCl、MgCl2、None，若设置了平衡电荷不支持选择None。缺省值：NaCl ion_concentration Float 离子浓度，单位mol/L，若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。最小值：0 最大值：5.0 缺省值：0.15 表7 ReceptorDrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表8 TargetOptLigand 参数参数类型描述 file ProbeDrugFile object 配体文件。 force_field String 配体力场, 支持选择gaff, gaff2。缺省值：gaff 表9 ProbeDrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表10 MdParam 参数参数类型描述 timestep_size Float MD模拟的时间步长，单位fs，取值范围：大于0，小于等于5。最小值：0 最大值：5.0 缺省值：2 temperature Float MD模拟的温度，单位K。最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：300 step_params MdStepParam object 计算步骤参数表11 MdStepParam 参数参数类型描述 energy_minimization_steps Integer 能量最小化的步骤。最小值：1 最大值：50000 缺省值：10000 nvt Float 等温等体步骤模拟的时长，单位ps。最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：200 npt Float 等压等温步骤模拟的时长，单位ps。最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：500 simulation_time Float 平衡步骤模拟的时长，单位ns。最小值：0 最大值：50.0 缺省值：50

医疗智能体 EIHEALTH 靶点优化作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点优化作业详情:URI

URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id} 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 project_id 是 String 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String 作业id。最小长度：1 最大长度：128

医疗智能体 EIHEALTH 靶点优化作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询分子搜索作业详情:响应示例

响应示例状态码： 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "SEARCH", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "start_time" : "2021-01-30T02:34:37Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name" }, "smiles" : "string", "top_n" : 100, "databases" : [ "databaseA", "databaseB" ], "custom_databases" : [ "custom_databaseA_id", "custom_databaseB_id" ], "search_method" : [ "ECFP_4" ] }

医疗智能体 EIHEALTH 分子搜索作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询分子搜索作业详情:URI

URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/search/{job_id} 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 project_id 是 String 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String 作业id。最小长度：1 最大长度：128

医疗智能体 EIHEALTH 分子搜索作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询分子搜索作业详情:响应参数

响应参数状态码： 200 表3 响应Body参数参数参数类型描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles String 分子SMILES表达式。最小长度：1 最大长度：1024 scaffold String 分子骨架表达式。最小长度：1 最大长度：1024 top_n Integer 生成分子数量。最小值：0 最大值：1000 databases Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。最小长度：1 最大长度：128 数组长度：0 - 10 custom_databases Array of strings 可供搜索分子的自定义数据库名称列表。最小长度：1 最大长度：128 数组长度：0 - 10 models Array of BasicDrugModel objects 模型信息。 search_method String 分子搜索方法。枚举值： ECFP_4 SCAFFOLD part_failed_reason Array of FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。表4 DrugJobDto 参数参数类型描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。表5 Progress 参数参数类型描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间，毫秒。表6 BasicDrugModel 参数参数类型描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object 区间上下限，仅回归型存在。 description String 模型描述信息。表7 ValueRange 参数参数类型描述 lower Float 区间下限，仅回归型存在。 upper Float 区间上限，仅回归型存在。表8 FailedReasonRecord 参数参数类型描述 reason String 失败原因。 count Integer 失败数量。

医疗智能体 EIHEALTH 分子搜索作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-启动作业:响应示例

响应示例状态码： 201 CREATED { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "app_infos" : [ { "app_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "app_name" : "demo-app", "app_version" : "1.0.0", "app_node_labels" : [ "health.node" ] } ], "job_info" : { "job_name" : "demo-job", "job_node_labels" : [ "health.node" ] } }

医疗智能体 EIHEALTH 作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-启动作业:请求示例

请求示例启动作业，其中作业的名称为demo-job，作业使用IO加速类型为SFS。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs { "name" : "demo-job", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "priority" : 0, "timeout" : 1440, "output_dir" : "/job", "tool_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "tool_type" : "workflow", "tasks" : [ { "task_name" : "app1-1", "inputs" : [ { "name" : "dir-parameter", "values" : [ "/test" ] } ], "io_acc_type" : "SFS", "resources" : { "cpu_type" : "X86", "cpu" : "1C", "memory" : "1G", "gpu_type" : "GPU", "gpu" : 0 } } ] }

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