靶点优化作业管理-华为云

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点优化作业详情:响应示例

响应示例状态码： 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "receptor" : { "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "balanced_charge" : true, "water_model" : "tip3p", "force_field" : "amber99sb", "ion_type" : "NaCl", "ion_concentration" : 0.15 }, "ligand" : { "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "force_field" : "gaff" }, "md_params" : { "timestep_size" : 2, "temperature" : 300, "step_params" : { "energy_minimization_steps" : 10000, "nvt" : 200, "npt" : 500, "simulation_time" : 50 } } }

医疗智能体 EIHEALTH 靶点优化作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点优化作业详情:响应参数

响应参数状态码： 200 表3 响应Body参数参数参数类型描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptor TargetOptReceptor object 受体文件。 ligand TargetOptLigand object 配体文件。 md_params MdParam object MD参数配置。表4 DrugJobDto 参数参数类型描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。表5 Progress 参数参数类型描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间，毫秒。表6 TargetOptReceptor 参数参数类型描述 file ReceptorDrugFileobject 受体文件。 balanced_charge Boolean 是否平衡电荷。缺省值：true water_model String 水模型, 支持选择spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p。缺省值：tip3p force_field String 蛋白立场，支持选择amber03, amber94, amber96, amber99, amber99sb, amber99sb-ildn, amberGS, charmm27, oplsaa, gromos43a1, gromos43a2, gromos45a3, gromos53a5, gromos53a6, gromos54a7。缺省值：amber99sb ion_type String 离子种类，支持选择NaCl、MgCl2、None，若设置了平衡电荷不支持选择None。缺省值：NaCl ion_concentration Float 离子浓度，单位mol/L，若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。最小值：0 最大值：5.0 缺省值：0.15 表7 ReceptorDrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如R CS B在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表8 TargetOptLigand 参数参数类型描述 file ProbeDrugFile object 配体文件。 force_field String 配体力场, 支持选择gaff, gaff2。缺省值：gaff 表9 ProbeDrugFile 参数参数类型描述 source String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000 表10 MdParam 参数参数类型描述 timestep_size Float MD模拟的时间步长，单位fs，取值范围：大于0，小于等于5。最小值：0 最大值：5.0 缺省值：2 temperature Float MD模拟的温度，单位K。最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：300 step_params MdStepParam object 计算步骤参数表11 MdStepParam 参数参数类型描述 energy_minimization_steps Integer 能量最小化的步骤。最小值：1 最大值：50000 缺省值：10000 nvt Float 等温等体步骤模拟的时长，单位ps。最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：200 npt Float 等压等温步骤模拟的时长，单位ps。最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：500 simulation_time Float 平衡步骤模拟的时长，单位ns。最小值：0 最大值：50.0 缺省值：50

医疗智能体 EIHEALTH 靶点优化作业管理

医疗智能体 EIHEALTH-查询靶点优化作业详情:URI

URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id} 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 project_id 是 String 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String 作业id。最小长度：1 最大长度：128

医疗智能体 EIHEALTH 靶点优化作业管理

云服务器内容精选

靶点优化作业管理

7*24

备案

专业服务

退订

建议反馈

售前咨询热线