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响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "start_time" : "2021-01-30T02:34:37Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "molecule_file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "num_trials" : 500, "binding_sites" : [ { "name" : "binding_name", "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/test.pdb" }, "bounding_box" : { "center" : [ 0, 0, 0 ], "size" : [ 500, 500, 500 ] }, "remove_ion" : false, "remove_water" : false, "remove_ligand" : true } ], "weak_constraints" : [ { "name" : "eye_corrosion", "type" : "bool", "bool" : true } ], "strong_constraints" : [ { "name" : "sascore", "type" : "range", "range" : [ 0, 1 ] } ] }
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响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles_list Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000 molecule_file DrugFile object 分子文件,分子表达式列表和分子文件二选一,分子文件优先级最高。 num_trials Integer 生成分子数量。 最小值:0 最大值:5000 initial_dataset_size Integer 初始化数据集的分子数目。当为-1时,表示分子数目未知。 最小值:-1 最大值:100000 binding_sites Array of BindSiteDto objects 靶点列表。 数组长度:0 - 2 weak_constraints Array of WeakConstraintDto objects 弱约束集合。 数组长度:0 - 16 strong_constraints Array of StrongConstraintDto objects 强约束集合。 数组长度:0 - 5 base_model BaseModel object 基模型。 models Array of BasicDrugModel objects 模型列表。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progressProgress Progress object 作业进度信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间,毫秒。 表6 DrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如R CS B在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表7 BindSiteDto 参数 参数类型 描述 name String 靶点名称,只能设置为target1或者target2。 最小长度:1 最大长度:128 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件 bounding_box BoundingBoxDto object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 remove_ion Boolean 去除受体中的离子。 缺省值:true remove_water Boolean 去除受体中的水分子。 缺省值:true remove_ligand Boolean 去除受体中的配体分子。 缺省值:true add_hydrogen Boolean 增加氢原子。 缺省值:false 表8 ReceptorDrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表9 BoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of doubles 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。 最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding Float 填充。 最小值:0 最大值:20 表10 WeakConstraintDto 参数 参数类型 描述 id String 自定义模型id,仅弱约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type String 属性约束类型。 枚举值: bool range struct minimize maximize interaction bool Boolean 属性约束类型bool的参数。 range Array of floats 属性约束类型range的参数。 最小值:-9999 最大值:9999 数组长度:2 - 2 struct StructureConstraintParamsDto object 结构约束参数。 quantiles Array of floats 属性约束类型minimize和maximize的参数。 最小值:0.0 最大值:1.0 数组长度:2 - 2 interaction InteractionConstraintDto object 相互作用力约束参数。 表11 StrongConstraintDto 参数 参数类型 描述 id String 自定义模型id,仅强约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type String 属性约束类型。 枚举值: bool range struct interaction bool Boolean 属性约束类型bool的参数。 range Array of floats 属性约束类型range的参数。 最小值:-9999 最大值:9999 数组长度:2 - 2 struct StructureConstraintParamsDto object 结构约束参数。 interaction InteractionConstraintDto object 相互作用力约束参数。 表12 StructureConstraintParamsDto 参数 参数类型 描述 structs Array of strings 子结构SMILES。 最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除子结构。 operator String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 InteractionConstraintDto 参数 参数类型 描述 interactions Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表14 Interaction 参数 参数类型 描述 binding_site String 靶点,只支持target1或target2。 最小长度:1 最大长度:128 type String 相互作用力类型:氢键、疏水作用、盐桥、π-π堆积、π-阳离子。 枚举值: hydrogen_bond hydrophobic_action salt_bridge pi_stacking pi_cation amino_acid String 氨基酸。 最小长度:4 最大长度:16 表15 BaseModel 参数 参数类型 描述 id String 基模型id。 缺省值:pangu-drug-model 最小长度:1 最大长度:128 name String 基模型名称。 缺省值:pangu-drug-model 最小长度:1 最大长度:128 表16 BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object 区间上下限,仅回归型存在。 description String 模型描述信息。 表17 ValueRange 参数 参数类型 描述 lower Float 区间下限,仅回归型存在。 upper Float 区间上限,仅回归型存在。
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URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/generation/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id 最小长度:1 最大长度:128
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