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响应示例 状态码: 200 查询配体文件预览任务成功响应。 { "status" : "finished", "result" : { "count" : 2000, "has_more" : true, "ligands" : [ { "index" : 0, "name" : "UNK1", "success" : true, "smiles" : "CC(=O)N[C@@H](Cc1ccc(CC(=O)O)c(C(=O)O)c1)C(=O)N[C@H]1CCCCN(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)C1=O", "formula" : "C33H35N3O7", "is_3d" : false, "structure" : { "format" : "PDB", "compressed" : true, "data" : "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" }, "reason" : null }, { "index" : 1, "name" : "UNK2", "success" : true, "smiles" : "COc1ccc(-c2cc(=O)c3c(O)cc(O[C@@H]4O[C@H](CO[C@@H]5O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]5O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]4O)cc3o2)cc1O", "formula" : "C28H32O15", "is_3d" : false, "structure" : { "format" : "PDB", "compressed" : true, "data" : "H4sIABt7PGUC/41YSY7dRgzd+xS6gIXiUNMy+DagRdLadO5/lXByuzqqTtiAJbik/8SZj7x+vv/x/tchf3AcL/n399ufR/zXbuUcsxzHdzh5DrmXE5rc4SxyWuz68fc6jm/XByAex/0EPKYAggG1znbvtXwBeH8CJPkCPgHHWUc1oFmn3bliSkL5/IuegP1sEKryMNVLKylAEePeSlhQjuW3wyQEMcFIqdzkC/wEbCdWtx1xt/vAnpJQ3nrVJ2AVgGqSUW8mqUmcABQ9Xm0nYZ8qIZ4wyAAb5SQUA736zobQPA5nHwbIBTKAIE9e4wnIJw1XuXZ3DnZKAWqmzCcgnYOKqdw1wBVQP5AARE298gBEkZAMcFI1wEopp4D86t4Etsadxh+fpboNK6dSDzRTRO8nYEM2G7bwcq85G1YFxAeg2CxSrvE8HIlTgBKD9zNTtBgMd8oo5IAjp7JmihhyA1i8ODAOA8SkhJopYsiNytOd0btLCJyqNiAGuutOZdRvSfgUzWlBIkxVG9RMEc/8G1CcQQ6IpYbKqThEQbifxUGcURoa0GTyQkszJaFlSnsA0knEJmFFiBbQUhJqTxFXPwF7m25DioqdC2xNh/tZvgRwNPdy0+zUMlZ7SmXLlPEArCfg9Erdo4zlqg1qpjzroQASjCj9EI2eUxJapswHoBRYqNHgXVKeMyWhZgqWDWAdPZhD9/CZqZ6ihnohbABxeJNC8PJVIJXLWufvufMysFdsK7RaYHNeJu0piDsJNeZVwu5hUyEV2GTsa2dDZjBJLac1DiHlZTL2RZuwweZAVF11yGWKJuz97Cnfm/RjD+hZXOUxcjbUTEHeOAVbs4ZfmscjUyoOSTMFdk6p5IC1/V/YfJZQMwXrph6CPlLAYA7cchIOlXDXpCY6YCcvsNhbSkLLlLZpAVauhOM0JZ7a+HMSaiu7YecUGOCAo1mhZUrZkC1T+o6KdLddJ0+9kas2rD0Fx459YTT67oC9pAJbK8D9bKOqandAiuLAraZUFsNc+9FsoI9m4KR94lc2vD4Bymev55wCkmrNUw6iL1csKUD5/EU7Cbt6WQK8UoxmY6QAJdgu3o1myM4cCKJyV0gBymev7eBjKhoLc1sS5FQWfa7t4FOLE84ZTYowJaEOwdd28BnNVW3kc8osNQUoCNd+8NGAVo5TugFCTmWdqq9N14PoKSIh9iDtKS9ro7g2TUoAm4+3zF5tmHISWqbArsBWl6yC38fIAWqmbFtAsdIvwO3X8DhTgJopm4ot4TJnVJ3uGdNzNtRM2RRYDu8KELhzoPUUoGbKZgqoQtZdVavY2hImpQA1U74g7V4UqDhwMlN0D3BtSftApyKoI7Wq/mXX+wyombLl2LYa0AXQ9PECKeUUjYlrS4lb8WpDbYS3U7mswXZtKLFMAUaW8Ow8AzgHqJmyocTSl3VA0OIQpL3kMqVZT8Ed+4pKXTQebZJKxaFytmtLOFnDRSUEp8Zl5iTUTNnwQ7EhtWCwrjpyLg41UzZ0rgmnjr7cnMlmbaiZgrtMARvN2MdaBf5yw/kJsGumPMmSMljbebHbUntKTkKlWNeTLIkTWGc9bacj2BemMkXFuHDulhiqogACeJNK9mUdky7a9RSobsOCv1IvB6iZQrCt2MVonY1mep85lTVTCDeEE6kGtx6xLf4vOve6336+3j8QMJiisTthZMtzNPq5HFBsv+Myl0cce2yJxuXUIPty0GKZ7Bcey6Mea2Ghf8vpiN2uX3j95DT28/tAHW1bVr/wIrmfWmDAcoqx9IwLL484to1+YVwe1dgbHrBoZgd1fa3H8s4vdZVmxBpOppLl1Pr4oo8RTIQYr4SkLI/AtlrLAcZWysZZ4R/LI4r9kpEIafzLI+tO67s1Nj02t0tPXx7ZuLX+uMfOxfYk0q6XRyParbVIaWvLoxl7ENtdSIP6/chO26KlvWHk1aRpi6B22pZQszdsmdcWGf1g0cKsY1O4Tc5tEdpO+2J/e8M2mGb/vvjKTvuilr2hQ6sUkt+nfrBoxBCTo1/6opGf0refbz++/QNW5Kl+XhsAAA==" }, "reason" : null } ] } }
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URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 task_id 是 String 任务ID,通过创建任务接口取得。 最小长度:1 最大长度:128
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URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/interaction2d 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128
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请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限, 获取Token 接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 receptor_file 是 ReceptorDrugFileReq object 受体文件。 ligand_file 否 DrugFile object 配体文件。 name 否 String 小分子名称。 最小长度:0 最大长度:128 表4 ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如R CS B在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data 否 String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 add_hydrogen 否 Boolean 增加氢原子。 缺省值:true 表5 DrugFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data 否 String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000
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请求示例 Fasta受体文件预览。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess { "file" : { "source" : "PUBLIC", "url" : "https://eihealth-public-material.obs.cn-north-7.ulanqab.huawei.com/fake.fasta" } }
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请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 FastaReceptor object 受体文件。 preview_count 否 Integer 预览数量。 最小值:0 最大值:100 缺省值:1 count_limit 否 Integer 计数上限。 最小值:0 最大值:100 缺省值:100 表4 FastaReceptor 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持FASTA,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data 否 String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000
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URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128
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响应示例 状态码: 200 查询配体相似性图计算任务成功响应。 { "status" : "finished", "result" : { "pairs" : [ { "success" : true, "ligands" : [ "FXR_74", "ligand" ], "similarity" : 0, "reason" : null } ] } }
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URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/similarity-graph/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 task_id 是 String 任务ID,通过创建任务接口取得。 最小长度:1 最大长度:128
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响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 status String 任务状态。 result LigandSimilarityGraphTaskResultDto object 配体相似度图任务结果。 表4 LigandSimilarityGraphTaskResultDto 参数 参数类型 描述 pairs Array of LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto objects 配体相似度图任务结果对列表。 数组长度:1 - 100 表5 LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto 参数 参数类型 描述 ligands Array of strings 两个配体名称。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:2 - 2 success Boolean 相似度计算是否成功。 similarity Float 配体对之间的相似度。 最小值:0 最大值:1 reason String 相似度计算失败的理由。 最小长度:1 最大长度:512
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URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 task_id 是 String 任务ID,通过创建任务接口取得。 最小长度:1 最大长度:128
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请求示例 创建分子或分子复合物批量下载任务。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/batch_download { "job_id" : "1296790078dbc", "mode" : "MOL", "selected" : [ 1, 3, 5, 7 ], "job_result_url" : "ch-test:/job-results/docking/Molecule Docking-20230825-conformation-test-8f8a/result.json" }
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URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/batch-download 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128
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请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 job_id 是 String 作业ID。 最小长度:1 最大长度:128 job_result_url 是 String 作业结果文件url。 最小长度:1 最大长度:2000 mode 是 String 下载类型:MOL(小分子)、COMPLEX(复合物)。 最小长度:3 最大长度:7 selected 是 Array of integers 选中下载的分子下标。 最小值:0 最大值:1000000 数组长度:1 - 10000
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