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基因研究一直是整个科学领域的一大高地。从技术实现的角度讲,基因测序工程集合了DNA聚合酶、纳米技术、高性能计算等领域尖端科技。如今第三代基因测序技术渐成主流。三代测序通过单分子实时测序、高分辨率光学图谱技术和长读特性在基因组研究中发挥着得天独厚的优势,对于农业、生命科学、医学等领域意义重大。
基因研究潜力无限,后端计算能力要跟上
武汉希望组作为国内首家三代测序服务公司,多年来深耕于三代测序分析领域,拥有最全面的平台及最丰富的项目经验,为合作伙伴提供优质、高效的基因组测序组装及分析服务,已经成为世界领先的三代测序基因组中心。
基因测序工程,动辄需要数万/数十万个基因测序及模型建立,需要大量的计算和存储资源。人体有23对染色体,31.6亿个碱基对,一次30倍的全基因组测序的数据量大约200Gb,基因转换—>拼接—>对比—>注释全流程,用一台高性能服务器运行耗时30多个小时。数万/数十万个基因测序任务,对网络、存储、算力及业务响应的及时性、可靠性、安全性有极高的要求。如果自建数据中心并且自运营运维,在技术、建设周期和成本上都面临巨大的挑战。
端到端高性能解决方案让瓶颈不再有
为解决面临的问题,希望组联手华为云。经过充分沟通、探讨和测试,华为云向希望组提供了从计算、存储、网络到部署与运维等的端到端解决方案。
华为云提供裸金属服务器、大容量内存和大规模核心计算资源池,资源快速就绪,使测序原始数据处理速度得到快速提升。
华为云贴近用户需求,综合运用 Docker、ARM等多种技术,将部分应用性能提升5-10倍。
华为云专业团队负责整体的运维管理,大大降低了希望组的IT运维压力,整体成本下降30%。
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专业的人做专业的事,华为云和希望组强强合作
希望组CEO汪德鹏先生表示:“此次希望组与华为强强联合,既是双方整合优质资源,提升自身竞争力的重要举措,也是双方拓展业务渠道、共同开发市场从而实现合作共赢的必然选择。双方不仅携手共开信息技术在三代测序平台应用之先河,同时也促进了信息技术和测序技术在医学、动植物等领域的发展,共同探索生命奥秘,让生命充满希望!”